대전 지하철은 대전교통공사(구 대전도시철도공사)에서 운영합니다.
수도권 지역은 기존 철도청에서 운행하던 국철 구간이 있어 지하철 운영도 같이 하고 있으며, 부산과 울산을 연결하는 동해선과 구미~대구~경산을 연결하는 대경선을 운행하고 있습니다.
열차 크기에 있어서도 대형 전동차인 서울과 달리 대전이나 광주 같은 곳은 중형 전동차를 쓰는 등 차이가 있습니다.
기본적으로 지하철은 각 지역의 지하철 운영기관에서 운영을 담당합니다.