혹시 아래 방법은 시도해보셨을까요?
한글 키보드 입력 시 자음과 모음이 따로 분리되어 입력되는 현상은 Microsoft Text Input Application 프로세스, 즉 윈도우 받아쓰기 기능 때문에 발생하는 경우도 있다고 하네요... (출처 : itmanual.net)
이 현상은 보통 윈도우 키 + H 키를 실수로 동시에 눌렀을 때 생기는데요... 해당 단축키는 음성 받아쓰기 기능을 활성화하는데, 한국어는 아직 정식 지원되지 않기 때문에 오류 메시지가 뜨면서 이러한 현상이 일어난다고 하네요..
아래 글 참고하시길.